突破性进展:上海交大洪亮教授团队打造全球最大蛋白质数据集,AI赋能精准蛋白质设计
近日,上海交通大学洪亮教授领衔的研究团队传来喜讯,他们在AI与蛋白质设计与改造领域的创新成果正式发布。该团队成功融合了人工智能技术,构建了全球规模最大的蛋白质数据集,为蛋白质功能预测和设计带来了革命性的变化。
从“试错”到“精准设计”:AI助力蛋白质生产效率飞跃
以往,蛋白质的生产过程往往依赖于“缓慢的试错”方法,这不仅耗时耗力,而且成本高昂。然而,借助新建立的蛋白质数据集,基于该数据集训练的模型能够实现精准、高效的蛋白质功能预测和设计,将生产过程从传统模式转变为“高效率的精准设计”。
蛋白质:不仅仅是食物中的营养素
蛋白质是人体必需的营养成分,存在于肉、蛋、奶等食物中。然而,天然的蛋白质往往难以直接应用于各种需求。因此,设计和改造蛋白质的功能,使其满足特定应用需求,成为了一个亟待解决的问题。
全球最大蛋白质数据集:Venus-Pod的诞生
洪亮教授团队开发的蛋白质序列数据集Venus-Pod(Venus-Protein Outsize Database)拥有近90亿条蛋白质序列,以及数亿个功能标签,成为全球数据规模最大、功能批注标签最多的数据集。这一成果不仅为AI模型提供了丰富的“学习材料”,还有望推动生物医药和合成生物学领域的快速发展。
Venus系列模型:AI定向进化和AI挖酶
Venus系列模型拥有两大核心功能:“AI定向进化”和“AI挖酶”。前者能够优化蛋白质产品的性能,使其满足应用需求;后者则可以从海量的未知功能蛋白质数据集中筛选出具有超常规功能的蛋白质,如极端耐热、耐酸、耐碱、耐胃肠消化等。
产业化应用:助力疾病诊断
令人振奋的是,Venus系列模型设计的多款蛋白质已实现产业化应用,并在阿尔兹海默等疾病的诊断领域展现出巨大潜力。
结语
上海交通大学洪亮教授团队的研究成果为蛋白质设计与改造领域带来了新的突破,不仅提高了生产效率,还有望为生物医药和工业生产带来革命性的变革。未来,随着AI技术的不断进步,我们有理由期待更多创新成果的诞生。
原文标题:《上海交大发布新模型Venus 建立全球最大蛋白质数据集》
栏目编辑:左妍 图片来源:上海交大
来源:新民晚报 王蔚
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